Las universidades, principales fuentes del saber, desempeñan un papel cada vez más importante en la actual sociedad del conocimiento, en la que han de actuar como guías hacia una sociedad cada vez más innovadora, y como referencia crítica para que sea más justa y solidaria.
La División Global Santander Universidades, expresión del compromiso de Santander con el progreso, vertebra con sus actividades la acción social del banco y le permite mantener una alianza estable con el mundo universitario en América, China, España, Portugal, Reino Unido y Rusia.
Entre 1996 y 2007, Santander ha destinado 500 millones de euros al patrocinio de proyectos académicos, de investigación y tecnológicos en apoyo de la educación superior.
Entre las actividades de Santander Universidades destaca la colaboración con las instituciones universitarias y de investigación, que puede considerarse el proyecto fundamental.
Son ya 700 las instituciones académicas que reciben el apoyo de Santander Universidades para el desarrollo de iniciativas relacionadas con:

• Proyectos docentes
• Ayudas al estudio y a la movilidad
• Programas de investigación
• Relación Universidad - Empresa
• Nuevas tecnologías
• Proyectos globales, como Universia y la Biblioteca Virtual Miguel de Cervantes
• Otras iniciativas: actividades culturales, deportivas, etc.

Recientemente, Santander ha firmado un acuerdo con la Asociación de Universidades de Grupo Montevideo a través del cual otorga 500 becas de movilidad por año para estudiantes de las Universidades adheridas.
En 2008, 25 estudiantes de la Universidad de la República se han beneficiado de este acuerdo y han viajado a realizar cursos en diversas Universidades del Cono Sur.